【2025年度版】IT導入補助金でECサイトは対象外！代わりに活用できる補助金を徹底解説

ECサイト構築にIT導入補助金は使えない！

IT導入補助金では、ECサイト構築は対象外です。
IT導入補助金の代わりにECサイト構築に使える国の補助金は以下の2つです。

• ものづくり補助金
• 小規模事業者持続化補助金

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ものづくり補助金

目的に沿った事業を行う上でECサイト構築が必要な場合は、ものづくり補助金を活用できる可能性があります。
ものづくり補助金は、中小企業の生産性向上、持続的な賃上げに向けて、 新製品・サービスの開発や生産プロセス等の省力化に必要な 設備投資等を支援する補助金です。
最大で1億円まで支給される可能性があり、事業の競争力強化を目指す企業にとって強力な支援策です。
申請には事業計画の提出が必要で、採択されると費用の一部が補助されます。

2025年版ものづくり補助金の概要はこちら！

基本要件

次の要件すべてを満たす「3～5年の事業計画書」を作成し、実行する必要があります。

1. 付加価値額の成長
2. 給与の成長
3. 最低賃金の水準
4. 従業員21人以上の事業者向け要件

1.付加価値額の成長

年間の付加価値額が平均で3％以上増加すること
「付加価値額」とは、簡単に言うと、会社が生み出した「新しい価値」のことです。
具体的には、売上から外部に支払った費用（材料費や外注費など）を引いたものを指します。
会社が生み出した「新しい価値」には、次のようなものが含まれます。

• 利益（会社が稼いだお金）
• 従業員の給料
• 会社が払う税金

つまり、付加価値額が大きいほど、会社は「利益を出し」、従業員に「たくさんの給料を払える」ということになります。

2.給与の成長

1人あたりの給与の年平均成長率が次のどちらかを満たすこと

• 事業を行う都道府県の最低賃金の直近5年間の年平均成長率と同等以上
• または、給与支給総額が年平均で2％以上増加すること

3.最低賃金の水準

事業を行う都道府県の最低賃金より30円以上高い賃金を支払うこと。

4.従業員21人以上の事業者向け要件

次世代育成支援対策推進法に基づく「一般事業主行動計画」を公表すること。
「次世代育成支援対策推進法に基づく一般事業主行動計画」とは、企業が従業員の子育てをサポートするための具体的な計画のことです。
例えば、「男性従業員の育児休業取得率を30％以上にする」などの目標があります。
「最低賃金引上げ特例」の適用を受ける事業者は、1、2、4の要件のみで構いません。
参考：令和6年度補正予算案「ものづくり・商業・サービス生産性向上促進補助金」の概要

申請枠

ECサイト構築にものづくり補助金を活用した事例

ECサイト構築にものづくり補助金を活用した事例を3つ紹介します。

活用事例1：ネット販売にチャレンジしたうどん屋のケース

課題：

• 製麺作業を職人が手作業で行っており、大量に生産できない。
• うどんの提供が店内に限られており、お土産用のうどんやネット販売をしていない 。

ものづくり補助金を活用し、以下を行いました。

• うどんをネット販売するためのECサイトを構築
• 熱いままで梱包でき、職人の技術と経験をデジタル化して品質の安定を図れる最新鋭のうどん製麺機を導入

 
結果：
生産性と品質が向上し、ECサイトでのネット販売やテイクアウト用のうどんの販路開拓に成功しました。

参考：ものづくり補助金

事業化面

事業化面は、事業化の方法スケジュールなどが具体的か、製品サービスの市場性があるか、企業の収益性・生産性は向上するか、を評価する項目です。
全枠共通の項目になります。

事業化面の審査項目の2点のポイントを踏まえて、ECサイト構築を申請する場合以下の通りになります。

活用事例2：キーホルダーをネット販売した製造業のケース

キーホルダーやアクセサリー、ノベルティー、キャラクターグッズ、玩具の開発・製造・販売を行う製造業。
携帯アクセサリーが強みで、国内外に仕入・外注先ネットワークを持ち、多品種小ロットで豊富なパーツを供給しています。
BtoBが中心でしたが、近年ではBtoCの販路拡大を目指しています。

課題：
海外からの仕入れの場合、ロット数が多く、以下2つの課題がありました。

• 小ロットでの受注の際、重量測定器の誤差が発生し、計量ミスが発生しクレームに繋がっている
• 日本語でサイトを更新した後に翻訳会社に委託して外国語の原稿を作りサイトを更新していたので、海外の顧客にタイムリーに最新情報を届けられない

ものづくり補助金を活用して以下2点を行いました。

• 多品種少量に対応した光学式の自動計量自動梱包機の導入した
• AI自動翻訳機能を持ったWEBサイトの開設を行い、日本語版の更新後すぐに外国語版に自動反映される仕組みを作った

結果：

• 多品種少量に対応した光学式の自動計量自動梱包機を導入により、計量ミスがなくなり、顧客満足度と社内処理の作業効率が向上しました。
• AI自動翻訳機能を持ったWEBサイトの開設により、翻訳会社を通さずに外国語に翻訳できるようになったので、最新の情報をタイムリーに海外に発信できるようになりました。

参考：ものづくり補助金

政策面

政策面は、地域経済への貢献や、我が国の経済発展のために国の経済政策として支援すべき取り組みかを審査する項目です。
全枠共通項目と大幅賃上げに係る補助上限額引上の特例のみの項目があります。

政策面の審査項目の2点のポイントを踏まえて、ECサイト構築を申請する場合以下の通りになります。

活用事例3：ネット販売を始めた和菓子店のケース

地元の特産品である栗を使用した和菓子店。
全国でも数少ない自社製造の栗餡を使用した商品が人気。
課題：

• 新商品の開発を行いたい
• 既存商品の味と風味の底上げを行いたい
• 店舗販売のみのため、顧客が近隣の住民に限られている
• 手作業による工程が多く、栗餡を加工するまでに多くの時間を要する上に処理量も限られている

ものづくり補助金を活用し、以下2点を行いました。

• 新たな加工ラインの導入
• 和菓子を販売するECサイトの構築

結果：

• 新たな加工ラインの導入で大幅な時間短縮を実現。既存商品の味と風味の底上げと、栗を使った日持ちのする新商品を開発できました。
• ECサイトによるネット販売により販路拡大に成功しました。

ものづくり補助金でECサイトを構築するには？

2025年度、ものづくり補助金の変更点は？

2025年度のものづくり補助金では、以下の3つの主要な変更点が発表されました。

1. 補助率の引き上げ
2. 補助上限額の見直し
3. 収益納付の廃止

それぞれの変更点について詳しく解説します。

1. 補助率の引き上げ

最低賃金の引き上げに取り組む事業者に対し、補助率が1/2から2/3に引き上げられました。
【対象条件】

• 従業員のうち地域別最低賃金+50円以上の者が30%以上を占めること。
• 条件を満たすことで、補助金額が大幅に増額されます。

この変更により、賃上げを積極的に推進する企業にとって、より有利な補助金制度となります。

2. 補助上限額の見直し

補助金の上限額が従業員数に応じて改定されました。特に従業員数21人以上の事業者にとっては、大きなメリットがあります。
補助上限額（従業員規模別）

この改定により、従業員数の多い企業ほど、高額な補助金を受けられるようになりました。

3. 収益納付の廃止

2025年度の公募要領では、「収益納付を求めない」という方針が明確に示されました。これにより、中小企業の成長促進がよりスムーズに行えるようになります。

収益納付とは？

これまで、補助金を活用して事業化し、収益が生じた場合、補助金交付額を上限にその収益の一部または全部を国庫に返納する義務がありました。
この仕組みは、補助金が適切に活用されることを目的として設けられていましたが、事業者の負担が大きいという声も多くありました。今回の変更により、補助金の使い勝手が向上し、より自由な事業展開が可能になります。

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小規模事業者持続化補助金

小規模事業者持続化補助金の「ウェブサイト関連費」という項目があるため、ECサイト構築費用が補助される可能性があります。

小規模事業者持続化補助金は、地域の雇用や産業を支える小規模事業者等の生産性向上と持続的発展を図ることを目的とし、持続的な経営に向けた経営計画に基づく販路開拓の取組を支援する補助金です。
具体的には、販路拡大や業務効率化を目的とした設備投資や広告宣伝費等の費用を補助します。

小規模事業者持続化補助金の概要はこちら！

補助対象者

小規模事業者持続化補助金の補助対象者は、以下に該当する小規模事業者です。

参考：小規模事業者持続化補助金パンフレット

小規模事業者の定義

「常時使用する従業員」とは、毎日働く正社員が基本です。アルバイトはフルタイムに近い場合が該当します。
小規模事業者持続化補助金では、直接雇用の従業員のみが対象で、派遣社員や役員、個人事業主本人は含まれません。ただし、役員でも現場で働く場合は該当する可能性があります。

しかし、たとえば役員でも毎日現場で働き、他の従業員と同様に業務を行っている場合は、「常時使用する従業員」に該当する可能性があります。
たとえば、建設業で現場監督を務める役員や、小規模店舗で接客を担当する店長兼役員などが該当するケースです。
このように、5人以下または20人以下という基準は、表面的な役職だけでは判断がつかない場合があります。
申請時には具体的な業務内容を精査し、基準に基づいて判断することが必要です。

たとえば、以下のような方々が対象になります。

• 家族経営の町工場
• 個人で建設業を経営している方
• 地域で美容室を経営している方

これらは一例ですが、条件に該当する小規模事業者の多くが申請可能です。

建設業が小規模事業者持続化補助金を活用する方法は？

採択率

過去16回の採択結果を基にした平均採択率は約60％ですが、直近では採択率が初めて30％台まで減少。
さらに、2024年の公募回数は2回と少なくなりました。

この背景には、コロナ禍における小規模事業者の「持続性」を保護する必要性が薄れたことが影響していると考えられます。
今後の補助金申請の傾向を把握する上で、これらのデータは重要な参考になりますので、ぜひおさえておきましょう。

補助対象経費

補助対象経費は、申請枠によって異なりますが、幅広い経費が対象になります。
【通常枠】【創業型】
機械装置等費、広報費、ウェブサイト関連費、展示会等出展費、旅費、新商品開発費、 資料購入費、 借料 、設備処分費 、委託・外注費
【共同・協業型】
会場の設営費・内装等の工事費、会場借料、機器・機材の借料、 広報費、旅費 など

補助額/補助率

【通常枠】

小規模事業者持続化補助金の通常枠とは？

【創業型】

小規模事業者持続化補助金の「創業型」とは？

【共同・協業型】

小規模事業者持続化補助金の共同・協業型とは？

【インボイス特例】

【賃金引上げ特例】

【災害支援枠】

小規模事業者持続化補助金の災害支援枠とは？

【ビジネスコミュニティ型】

小規模事業者持続化補助金の特徴

小規模事業者持続化補助金の大きな特徴は以下2つです。

• 幅広い活用範囲
• 商工会議所や商工会の協力が必須

特徴1：幅広い活用範囲

小規模事業者持続化補助金は、さまざまな事業活動に利用できます。
販路開拓はもちろん、以下のような取り組みも対象となります。

• ITを活用した業務効率化（例：クラウドサービスの導入）
• 新規事業の立ち上げ（例：新商品の開発や販売）
• プロモーション活動（例：広告やウェブサイト制作）

事業の成長を目指す幅広い取り組みに対応しており、自社のニーズに合わせて柔軟に活用できます。
特徴2：商工会議所や商工会の協力が必須

この補助金は商工会と連携して申請します。商工会では相談やアドバイスを受けられるため、申請のハードルは低めです。商工会員でなくても利用可能なので、安心して活用してください。

小規模事業者持続化補助金を活用してECサイト構築する際の注意点

小規模事業者持続化補助金を活用してECサイト構築する際の注意点は以下3点です。

• ECサイト構築のみの申請は不可
• ECサイト構築は「ウェブサイト関連費」で申請できる
• 「ウェブサイト関連費」は申請額の1/4まで補助される

ECサイト構築のみの申請は不可

「ウェブサイト関連費」を申請する際は、必ずほかの経費と組み合わせて申請します。
そのため、ECサイト構築の費用のみの申請は不可です。
補助対象経費には「旅費」「借料」「広報費」などさまざまな補助対象経費があります。

ECサイト構築＋他経費の申請事例

店舗販売のみを行っていた洋菓子店がECサイトを構築し、食品の販売を開始する場合、以下のような他経費との組み合わせができます。

ECサイト構築は「ウェブサイト関連費」で申請できる

小規模事業者持続化補助金には11種類の補助対象経費が設けられており、ECサイト作成は「ウェブサイト関連費」に該当します。

「ウェブサイト関連費」は申請額の1/4まで補助される

「ウェブサイト関連費」は、申請金額の最大1/4までの経緯が補助されます。
例えば、「ウェブサイト関連費」と「機械装置等費」で「通常枠」へ申請する場合は、2つの費用を別々に計算し、最後に申請額の1/4以下の金額を「ウェブサイト関連費」として申請します。

計算方法

【申請する経費】

• 機械装置等費（厨房機器導入費用）：80万円
• ウェブサイト関連費（ECサイト構築費用）：30万円

【「通常枠」の補助上限額・補助率】

1. それぞれの経費に補助率を掛ける
機械装置等費費：80万円×2/3＝53万円
ウェブサイト関連費：30万円×2/3＝19万円
申請額は55万円+19万円＝72万円です。
2. 申請額が補助上限額を超えていないかチェックする
「通常枠」の補助上限額は50万円です。
申請金額72万円＞補助上限額50万円となり、上限額を超えているので50万円を申請します。
3.申請額の1/4以下の金額が「ウェブサイト関連費」として申請できる
申請額の1/4が「ウェブサイト関連費」として申請できるので、50万円×1/4＝12万円となります。
【申請額50万円の内訳】

• 機械装置等費：38万円
• ウェブサイト関連費：12万円

小規模事業者持続化補助金でECサイトを作ろう！対象経費と採択のコツは？

ECサイト構築に小規模事業者持続化補助金を活用した事例

ECサイト構築に小規模事業者持続化補助金を活用した事例を3つ紹介します。

活用事例1：古民家カフェのテイクアウト＆EC展開のケース

築70年の古民家を改装した隠れ家カフェ。
自家焙煎コーヒーと地元食材を使った手づくりスイーツが評判で、観光客や地元客に人気を集めている。
課題：
・地方立地のため、観光シーズン以外は来店客が少ない
・リピーターから「お土産に買いたい」「家でも楽しみたい」という声が多いが対応できていない
・SNSでの発信は行っているが、注文につながる仕組みがない
小規模事業者持続化補助金を活用し、以下2点を実施しました。
・看板商品の「焼き菓子セット」や「オリジナルブレンドコーヒー」のECサイト販売を開始
・テイクアウト対応のためのパッケージデザインや店頭POPなどの販促物を制作
結果：
観光シーズン外でも安定した売上を確保できるようになり、全国からの注文が増加。
ECサイトには「旅先で出会った味をもう一度楽しみたい」というリピーターの声が多く寄せられ、ブランドのファンづくりにも成功。
店頭でも「オンラインで見た」と新規客の来店が増え、相乗効果が生まれた。

活用事例1：地域密着のアロマ専門店のケース

地方都市で長年営業してきたアロマ専門店。
香りにこだわった天然精油の調合や、オリジナルのアロマキャンドルが地域のファンから高い支持を得ている。
課題：
・既存顧客の多くがリピート客だが、新規顧客の獲得が難しい
・SNSでの発信はしているが、購入までの導線が整っていない
・店舗が郊外にあり、交通手段が限られるため遠方からの来店が少ない
小規模事業者持続化補助金を活用し、以下2点を実施しました。
・自社オリジナル商品の魅力を伝えるECサイトの新規構築
・SNS広告と連動したプロモーション動画の制作と掲載
結果：
ECサイトの開設により全国からの注文が入るようになり、特にギフト需要の増加につながった。
動画によって商品の使い方や香りのイメージを視覚的に伝えることで、新規ユーザーからの購入率が向上。来店に依存しない売上の柱を作ることに成功した。

2025年、小規模事業者持続化補助金の変更点は？

2025年度の小規模事業者持続化補助金では、以下の3つの主要な変更点が発表されました。

1. 補助金の方向性の変化
2. 卒業枠・後継者支援枠の廃止
3. 共同・協業型、ビジネスコミュニティ型の新設

それぞれの変更点について詳しく解説します。

1.補助金の方向性の変化

近年の社会状況に応じて、補助金の目的も変化しています。
これまでの補助金はコロナ禍における緊急支援が中心でしたが、2025年度はインボイス制度の普及、賃上げ支援、経済連携の強化へと重点が移行しています。

また、従来の災害支援枠などの支援策は引き続き維持されますが、補助金の目的は「短期的な支援」から「経済発展を促進するための支援」へとシフトしていることが分かります。
2025年度の変更により、補助金の対象や活用方法が広がり、より大規模な事業展開が可能になりました。補助金の活用を検討する事業者は、新たな枠組みを理解し、より広い視野で事業計画を立てることが重要です。

2. 卒業枠・後継者支援枠の廃止

2025年度より、「卒業枠」と「後継者支援枠」 が廃止されました。

• 後継者支援枠：「アトツギ甲子園」という中小企業庁主催の後継者の事業展開がどれほど優れているかを決めるコンテストがあり、そこで優秀な成績を残した人が申請できる枠。
• 卒業枠：事業拡大により小規模事業者から中小企業へ成長する事業者向けの枠。

この廃止により、残されたのは「賃金引上げ特例」と「インボイス特例」のみとなりました。これは、行政が現在の政策として「賃上げ支援」と「インボイス制度の定着」を特に重視していることを示しており、事業計画を作成する際にも意識すべきポイントです。
参考：アトツギ甲子園 公式ホームページ

3. 共同・協業型、ビジネスコミュニティ型の新設

新たに以下の2つの枠が設けられました。

• 共同・協業型：地域振興等機関が主体となり、10以上の小規模事業者の販路開拓を支援する枠。
• ビジネスコミュニティ型：商工会・商工会議所の内部組織などを支援し、地域のビジネスネットワーク強化を目的とした枠。

これにより複数の事業者が連携するプロジェクトや地域のビジネス活性化を目的とした取り組みが補助対象となり、支援の幅が広がりました。

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補助金を活用してECサイトを構築したい方はこちら！

ものづくり補助金や小規模事業者持続化補助金は、申請して採択されないと補助金がもらえません。
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